Если там какая-то огромная установка и есть доп. логика - это одно. Тогда да, можно и поковыряться с бэкапом.
Если же у вас десяток IP-телефонов, транк в город и всё - настройте заново новую систему на новом дистрибутиве, будет быстрее, меньше проблем в процессе и заодно научитесь.