Вы не поняли... в консоли выводится время уже московское GMT+3. В CLI Астериска выводится лондонское, в логах пишется лондонское, т.е. UTC
Кроме этого, Вы секунды посчитали за минуты...
В logger.conf смущает вот что:
[general]
;
; Customize the display of debug message time stamps
; this example is the ISO 8601 date format (yyyy-mm-dd HH:MM:SS)
;
; see strftime(3) Linux manual for format specifiers. Note that there is also
; a fractional second parameter which may be used in this field. Use %1q
; for tenths, %2q for hundredths, etc.
;
dateformat=%F %T ; ISO 8601 date format
Т.е. выводить в логи в CLI именно в формате ISO 8601, а это есть лондонское время. Как приплюсовать 3 часа? Или как прописать, чтобы выводил GMT?